Archiwum i Zbiór Rękopisów Biblioteki Czartoryskich obejmuje ponad 14.000 rękopisów od średniowiecza do czasów współczesnych. Znajdują się tu dokumenty pergaminowe od XII do XIX w. o znaczeniu narodowym m.in. przywilej jedlneński (1430 r.), przywilej koszycki (1374 r.), unie w Horodle (1413 r.), czy dokument Hołdu Pruskiego (1525 r.), a także ważne dokumenty rodzinne m.in. nadanie tytułu książęcego dla Czartoryskich w 1442 r. czy też dyplom honorowego obywatelstwa miasta Krakowa dla Władysława Czartoryskiego (1880 r.).
Ponadto zbiór zawiera dokumenty, listy, pamiętniki, prace literackich, naukowych, historycznych, muzycznych (m.in. Fryderyka Chopina), artystycznych (m.in. Piotra Norblina) autografów znanych osób (m.in. Mikołaja Kopernika) od XV w. do XX wieku w formie luźnej lub w woluminach – do dziejów Polski i dziejów powszechnych.
Kontrakt pomiędzy Gminą miasta Krakowa a Władysławem Czartoryskim o odstąpieniu Arsenału i murów miejskich przy Bramie Floriańskiej na pomieszczenie zbiorów muzealnych i bibliotecznych, Kraków 1874
Prawo do wieczystego użytkowania książęcej pieczęci Władysław II król węgierski i polski zatwierdza Iwanowi, Aleksandrowi i Michałowi książętom z Czartoryska, swoim krewnym, prawo wieczystego używania ich książęcej pieczęci przedstawiającej siedzącego na koniu uzbrojonego jeźdźca z podniesionym, obnażonym mieczem w dłoni, Buda 14 VI 1442
Dokument określający charakter połączenia Wielkiego Księstwa Litewskiego z Koroną Polską Władysław król polski i najwyższy książę litewski oraz Aleksander czyli Witold wielki książę litewski określają charakter połączenia Wielkiego Księstwa Litewskiego z Koroną Polską i nadają szereg przywilejów tym bojarom litewskim, którzy przyjęci zostają do herbów szlachty polskiej. Horodło, 2 X 1413
Porozumienie duchownych i panów polskich z Wiloldem wielkim księciem Litwy Duchowni i panowie polscy po porozumieniu się z Witoldem wielkim księciem Litwy oraz panami litewskimi przyrzekają, że po śmierci króla Władysława Jagiełły uznają i ukoronują na króla polskiego jego syna, pod warunkiem zatwierdzenia praw i przywilejów. Zapewniają, że sprzeciwią się każdemu buntownikowi, kto nie uzna przyszłego króla. Jedlnia, 4 III 1430
Dokument traktatu zawartego między Zygmuntem królem Polski a Albrechtem margrabią brandenburskim Jerzy margrabia brandenburski i Fryderyk książę brzesko-legnicki wystawiają dokument traktatu zawartego między Zygmuntem królem Polski a Albrechtem margrabią brandenburskim, na mocy którego likwiduje się stan wojny między stronami, a utworzone z ziem pruskich świeckie księstwo jako lenno króla i Korony Polskiej pozostaje jako dziedzictwo Albrechta; traktat reguluje także stosunki gospodarcze i handlowe między obu krajami. Kraków, 8 IV 1525